子宫内膜异位症难以根除，但却不是不可治疗的，常用的办法有药物和手术两种：
１．药物治疗：常用药物有孕激素类避孕药、丹那唑和棉酚等。这些药物作用不同，但效果却不相上下。关键在于在长期应用过程中调好剂量，不使月经来潮，即可发挥治疗作用。但服药仅适用于直径在２厘米以下的小型病变，病情较重或病变较大者应依靠手术治疗。
２．手术治疗：对于年轻仍要求生育的妇女，可以通过腹腔镜或开腹手术，用激光、电凝及切除等办法，尽量消灭盆腔中的子宫内膜异位病变，保留生育机能，术前后配合药物治疗以促进疗效如年龄较大已无生育机能，则最好切除子宫以减少复发的机会。接近更年期的患者，可以同时切除双侧卵巢，使异位的子宫 内膜失去刺激其生长的性激素来源，因而起到根治的效果。
